Főbb művei

F. m.: A Beregi sík rét–legelőtársulásai. 1–2. (Acta Universitatis Debreciensis, 1958–1960
és külön: Debrecen, 1960)
A modern növényökológia helyzete és problémaköre. (Acta Universitatis Debreciensis, 1962)
Investigation on the Coexistence Theory of Plant Communities. (Acta Biologica, 1962)
Az elméleti modellek szerepe a növényökológiai kutatásban. (Botanikai Közlemények, 1962)
A biogeocönózis-elmélet állása és problémái. (Acta Biologica Debrecina, 1962)
Investigations on the Bulgarian Vegetation. Some Hygrophilous Plant Communities. 1–3. – Rasszkülönbségek befolyása allelopatikus kölcsönhatásokban. Lukácsovics Erikával. (Acta Biologica Debrecina, 1963)
A sejt szerveződése. (Élővilág, 1963)
Talajtan mint a növényökológia alapja. Egy. jegyz. Simon Tiborral. (Bp., 1963
2. kiad. 1969
6. kiad. 1986
8. kiad. 1990
9. kiad. 1993
10. kiad. 1994)
Causal–Ecological Analysis of Two Connected Grassland Stands. (Journal of Ecology, 1964)
Continuum Studies on Meadow Vegetation. (Acta Botanica, 1964)
Some Theoretical Models of Cenological Fidelity. (Acta Biologica Debrecina, 1964)
A sejt szerveződése. (Élővilág, 1964)
Some Theoretical Problems of Synbotany. 1–3. (Acta Biologica Debrecina, 1966–1968)
On Associations among Plant Communities. (Acta Biologica Debrecina, 1967)
Egy operatív ökológia hiánya és szükséglete. (MTA Biológiai Tudományok Osztálya Közleményei, 1970)
Some Problems of Model Building in Synbiology. Dévai Istvánnal, Horváth K.-val. 1–2. (Annales Universitatis Budapestinensis. Sectio Biologica, 1971–1973)
Elemi preferenciális folyamatok információelméleti modellezése szünbotanikai objektumokon. Kand. értek. (Debrecen, 1972)
A növényzet szerkezetvizsgálata. Új modellek. 1–4. (Botanikai Közlemények, 1972–1985)
Szupraindividuális organizáció. Vida Gáborral. (A biológiai szabályozás. Szerk. Csaba György. Bp., 1978)
Dialógus-töredékek az ökoszisztémáról. (Természet Világa, 1978)
A környezetvédelem ökológiai alapjai. (MTA Biológiai Tudományok Osztálya Közleményei, 1979)
A cönológia koegzisztenciális szerkezeteinek modellezése. Doktori értek. (Bp., 1980)
Esettanulmány a hidrobiológiai kölcsönhatásokról egy szennyvíztisztító berendezésnél. Dévai Györggyel, Dévai Istvánnal. (Acta Biologica Debrecina, 1981)
Investigation on Diversity of Hungarian Mortality Statistics. Izsák Jánossal. (Annales Universitatis Budapestinensis. Sectio Biologica, 1981)
Bevezetés a biomatematikába. Monográfia és egy. tankönyv is. Izsák Jánossal, Varga Zoltánnal. (Bp., 1981
2. kiad. 1982)
Betegség-mintázatok vizsgálatáról. Izsák Jánossal. (Magyar Tudomány, 1982)
Javaslat a vízminőség fogalomrendszerének egységes értelmezésére. Dévai Györggyel, Dévai Istvánnal. (Acta Biologica Debrecina, 1982)
Beszélgetések az ökológiáról. (Bp., 1984)
Notes on Diversity. (Abstracta Botanica, 1984)
Studies of Diversity Indices on Mortality Statistics. Izsák Jánossal. – Diversity Studies on Mortality Data. Izsák Jánossal. (Annales Universitatis Budapestinensis. Sectio Biologica, 1984)
A biológia főbb fejlődésvonalai. 1–2. (Természet Világa, 1985)
Ökológia és ökonómia. (Világosság, 1985)
A biológia fogalomrendszerének néhány problémája. 1–2. (Abstracta Botanica, 1985–1986)
Egy operatív ökológia hiánya, szükséglete és feladatai. Monográfia. (Bp., 1986)
Villám-recenziók és egyéb észrevételek. (Abstracta Botanica, 1986)
„Kulturális ökológia.” Néhány kritikai észrevétel. (A kultúra ökológiája. Tanulmányok. Szerk. Cs. Varga István. Tatabánya, 1987)
Törvényszerűségek a természetben, avagy nagyon töredékes vitaváltozatok a szupraindividuális organizáció – SIO – hatalmas témájára. (A tökéletlenség és korlátosság dicsérete. Szerk. Koch Sándor. Bp., 1989)
Az ökológia reménytelen reménye. A posztgraduális humánökológus képzés előadásainak anyaga. Zsolnai Lászlóval. (Humánökológia. Az ELTE kiadványsorozata. Bp., 1991)
A szünbiológiai modellezés útjai. Akadémiai székfoglaló. (Elhangzott: 1991. dec. 17.)
Vázlatok az ökológiai kultúra tematikájához. (Ökológiai kultúra – ökológiai nevelés. A Természet- és Környezetvédő Tanárok Egyesülete kiadványsorozata. Bp., 1992)
Az ökológiai megértés problémái. (Magyar Tudomány, 1992)
Természet és ember. Kis változatok egy nagy témára. Vál. tanulmányok. Szerk. T. Balla Gizella. (Bp., 1993)
Az eltűnő sokféleség. A bioszféra-kutatás egy központi kérdése. (Bp., 1993)
A szünbiológia alapjai. Fejezetek egy alig megkezdett könyvből. (Synbiologica Hungarica. 1. Bp., 1995)
szerk.: Korach Mór: A műszaki kémia mint tudomány. Sajtó alá rend., az utószót írta. (Bp., 1982).

Irodalom

Irod.: Dobó Andor: Izsák János–J. N. P.–Varga Zoltán: Bevezetés a biomatematikába. (Magyar Tudomány, 1982)
Fekete Gábor: J. N. P.: Egy operatív ökológia hiánya, szükséglete és feladatai. (Magyar Tudomány, 1987)
Kultúrökológia? Ökológiai kultúra! Beszélgetés J. N. P. egyetemi tanárral. (Élet és Tudomány, 1989. 20.)
„Kétszemélyes egyetem.” Tizenegy beszélgetés. Tudósportrék. (Bp., 1990)
Csorba László–Schüttler Tamás: Beszélgetések J. N. P.-lal. (Új Pedagógiai Szemle, 1992)
„Ha nincs önálló szellemed, ugyan ki véd meg?” J. N. P. akadémikussal beszélget Szathmáry Eörs. – Vekerdi László: Jelentés J. N. P. Természet és ember című könyvéről. – Podani János: J. N. P. emlékezete. Az életút állomásai. (Természet Világa, 1993)
In memoriam Pál Juhász Nagy. Szerk. Podani János, Czárán Tamás. – Podani János–Szathmáry Eörs: In Search of Truth – Pál Juhász Nagy’s Life and Work. (Abstracta Botanica emlékszám. Bp., 1993)
Simon Tibor: J N. P. (Magyar Tudomány, 1993)
Scheuring István: Gondolatok az ökológia törvényszerűségeiről. In memoriam J. N. P. (Természet Világa, 1994)
Fekete Gábor: J. N. P.: Az eltűnő sokféleség. A bioszféra-kutatás egy központi kérdése. (Magyar Tudomány, 1994)
Teremtő sokféleség. Emlékezések J. N. P.-ra. Az 1999. ápr. 28-án Feltűnő sokféleség címmel rendezett tudományos emlékülés előadásai. Szerk. Oborny Beáta. (Az MTA Ökológiai és Botanikai Kutatóintézete kiadványa. Vácrátót, 2001)
Szupraindividuális biológiai kutatások. Az MTA Szupraindividuális Biológiai Kutatócsoportja által 1998. nov. 16-án, J. N. P. emlékére rendezett konferencia előadásai. (Az MTA Ökológiai és Botanikai Kutatóintézete kiadványa. Vácrátót, 2002)
Simon Tibor: Hetven éve született J. N. P. Időtálló életmű. (Természetbúvár, 2005)
J. N. P.-díj alapítása. (Magyar Tudomány, 2005).