Főbb művei

F. m.: Magyar mythologia. (Pest, 1854
2. kiad. Szerk. Zajti Ferenc. 1929
3. kiad. Buenos Aires, 1977
hasonmás kiad. Bp., 1987)
Adalék Magyarország XIII. századi helyirata és földrajzához. (Uj Magyar Muzeum, 1859)
Csallóköz műemlékei. Egy abrosszal és hat képpel. A bevezetőt Toldy Ferenc írta. (Magyar műemlékek. I. Pest, 1859)
A deákmonostori XIII. századi román basilika. Hely- és műtörténeti monographia rajzokkal. Akadémiai székfoglaló is. (Elhangzott: 1860. márc. 5.
megjelent önálló kötetben: Pest, 1860
új kiad. Sajtó alá rend. Koncsol László Pozsony, 2004)
Téglaépítészeti műemlékek. Régi magyar keresztkutak és Magyarország czímerének monumentalis használata. (Magyar műemlékek. II–III. köt. Pest, 1861)
Magyar ereklyék. Két képtáblával és a szövegbe nyomott 26 fametszettel. Akadémiai székfoglaló is. (Elhangzott: 1862. okt. 6.
Archaeologiai Közlemények, 1863)
A középkori emlékszerű építészet Magyarországon. (Pest, 1863)
A középkori magyar festészet emlékeiből. A szepesváraljai XIV. századi történeti falfestmény. (Pest, 1864)
Az egri megye Szent János apostol és evangélistáról nevezett régi székesegyháza az egri várban. (Eger, 1865)
A kunok bél-három-kúti, másképp apátfalvi apátsága és XIII. századi egyházának leírása. Hely- és műtörténeti monographia. Hét rézbe metszett képtáblával és a szövegbe nyomott három fametszettel. (Archaeologiai Közlemények, 1866)
A szihalmi magyar pogánykoriaknak vélt leletek. (Századok, 1870)
Beszterczebánya városa műveltségtörténeti vázlata. (Századok, 1874
önállóan: Bp., 1874
németül: Wien, 1875
2. kiad. A szöveget gondozta Koncsol László. Pozsony, 2005)
I. A. kisebb munkái. I–V. köt. A III. kötettől sajtó alá rend. Bunyitay Vince. (Bp., 1874–1888)
Veresmarti Mihály XVII. századi író élete és munkái. Korrajz a hitújítás korából. (Bp., 1875)
A beszterczebányai egyházi műemlékek története és helyreállítása. Hét szín- és kőnyomatú képtáblával és 54 fametszettel. (Bp., 1878
2. kiad. Pozsony, 2005)
I. A. műtörténelmi tanulmányai. (Bp., 1884)
A magyar szent korona és a koronázási jelvények történeti és műtörténeti leírása. 4 színezett táblával és szövegbe nyomozz ábrákkal. (Bp., 1886
hasonmás kiad. 2005)
Bedegi Nyáry Krisztina. 1604–1641. 9 önálló melléklettel és 37 szövegbe nyomott képpel. (Magyar Történeti Életrajzok. Bp., 1887)
I. A. népmesegyűjteménye. Szerk. Kálmány Lajos. (Magyar népköltési gyűjtemény. 13. Bp., 1914)
Egyház, műveltség, történetírás. Rómer Flóris, I. A., Fraknói Vilmos. Vál., sajtó alá rend., a kísérő tanulmányt írta Rottler Ferenc. (Történetírók tára. Bp., 1981)
Csallóközi uti-képek. Sajtó alá rend. az előszót írta Koncsol László. (Csallóközi kiskönyvtár. 1. Pozsony, 1993
2. kiad. 2000)
Csallóköz műemlékei. Sajtó alá rend. Koncsol László, az utószót írta Hushegyi Gábor. (Csallóközi kiskönyvtár. Pozsony, 1994)
Tanulmányok a középkori magyar művészetről. Szerk. Verő Mária, a bevezető tanulmányt írta Prokopp Mária. (Bp., 1997)
Magyar mythologia. Szerk. Zajti Ferenc. A 2. kiad. hasonmás kiadása. (Bp., 2002)
Fehér-hegyi útiképek. Sajtó alá rend. Koncsol László. (Pozsony, 2004)
A tengeri kisasszony. I. A. kéziratos folklórgyűjteménye egész Magyarországról. 1846–1858. Közreadta Benedek Katalin. (Bp., 2006)
Csallóközi népmesék és mondák. I. A. folklórgyűjteményéből és saját gyűjtéséből vál., a szöveget gondozta Kocsis Aranka. (Pozsony, 2007)
szerk.: Emlékkönyv kisapponyi Bartakovics Béla érsek aranymiséjének ünnepére. (Eger, 1865)
Oláh Miklós… levelezése. Közli I. A. (Magyar történelmi emlékek. I. Okmánytár. Bp., 1875)
Veresmarti Mihály munkái. Kiadta I. A. (Régi magyar egyházi írók. 2. Bp., 1878)
Alsó-sztregovai rimai Rimay János államiratai és levelezése. Kiadta. A bevezető tanulmányt Szilágyi Sándor írta. (Bp., 1887).

Irodalom

Irod.: Fraknói Vilmos: Emlékbeszéd I. A. ig. és r. tag fölött. (MTA Emlékbeszédek. Bp., 1886)
Pór Antal: I. A. váradi püspök és munkái vázlata. (Pozsony–Bp., 1886)
Deák Farkas: I. A: emlékezete. (Turul, 1887)
Bunyitay Vince: I. A. irodalmi munkássága. 1845–1886. (I. A. kisebb munkái. V. köt. Bp., 1888)
Czobor Béla: I. A. emlékezete. (Bp., 1899)
Thienemann Tivadar: Grimm Jakab és I. A. (Egyetemes Philologiai Közlöny, 1923)
Gerevich Tibor: I. A. (Bp., 1923)
Hekler Antal: I. A. emlékezete. (Századok, 1923)
Hellebrant Árpád: I. A. levelei Toldy Ferenchez. (Irodalomtörténeti Közlemények, 1928)
Kovács Ágnes: I. A. folklórgyűjteménye a Néprajzi Múzeum Kéziratgyűjteményében. (Néprajzi Értesítő, 1956)
Hoppál Mihály: I. A. (A múlt magyar tudósai. Bp., 1980)
Molnár Veronika: I. A. hímzésgyűjteménye az esztergomi Keresztény Múzeumban. Sajtó alá rend. Bodné Bobrovszky Ida. (Bp., 1983)
Hoppál Mihály: I. A. élete és műve. – Kovács Zoltán: I. A. műveinek válogatott bibliográfiája. (I. A. Magyar mythologia. Hasonmás kiad. Bp., 1987)
I. A. Emlékkönyv. Halálának századik évfordulója alkalmából az esztergomi Keresztény Múzeumban rendezett emlékülés anyaga. Szerk. Cséfalvay Pál, Ugrin Emese. (Bp., 1989)
Krupa András: I. A. Magyar mythologiájának szlovák forrásai. (Ethnographia, 1990)
R. Takács Olga: „Róma ellenállhatatlan”. Vonások két századvégi pap- tudós portréjához. (Vigilia, 1992)
Lővei Pál: Egyházi személyiségek a magyar műemlékvédelem történetében. (Műemlékvédelmi Szemle, 1993)
Hála József: I. A. és Hont vármegye. (Ethnographia, 1995)
Ruzsa György: Az ikongyűjtés kezdetei Magyarországon. (Posztbizánci Közlemények, 1995)
Verebélyi Kincső: I. A. hímzésgyűjteménye. – Szulovszky János: A tárgyi világ felfedezése. I. A. tudománytörténeti szerepéről. (Ethnographia, 1999)
Szulovszky János: Egy téves adat terjedése. A Magyar mythologia köteteit elégető I. A. legendájának forrásai. (Valóság, 2002)
Ujváry Zoltán: Néprajzi vonások I. A. útirajzaiban. (Ethnographia, 2002)
Dukrét Géza–Verő Mária: I. A. (Magyar múzeumi arcképcsarnok. Bp., 2002).